人工智能以及云计算技术的快速发展,精准医学与医学大数据在生命科学领域的作用越来越明显。在人工智能的潮流中,中医药也迎来了新的发展契机。网络药理学是人工智能和大数据时代药物系统性研究的新兴、交叉、前沿学科,强调从系统层次和生物网络的整体角度出发,解析药物及治疗对象之间的分子关联规律,被广泛应用于药物和中药活性化合物发现、整体作用机制阐释、药物组合和方剂配伍规律解析等方面,为中药复杂体系研究提供了新思路,为临床合理用药、新药研发等提供了新的科技支撑。
在大数据背景下,随着网络药理学的影响力和应用日益广泛,网络药理学在理论分析、算法发展和实际应用等方面,面临着重要的发展机遇和挑战。整合临床、实验的海量数据,结合科学验证,揭示药物对疾病的调控机制,是网络药理学研究的主要任务。
中医药是中华民族的宝贵财富,在疾病防治方面具有独特的优势。中医整体观与以网络和系统为特征的新一代医学研究范式相吻合。中医提出了一种全新的“网络靶标”方法,即网络药理学的核心理论和方法。中医也是网络药理学的一个重要研究对象。中医网络药理学,旨在了解复杂疾病、中医证候和中药治疗的网络生物学基础,在网络药理学的起源和发展过程中起着至关重要的作用。
为更好地了解网络药理学的新进展,包括预测中药靶标,了解疾病和证候的生物学基础,中药方剂的网络调控机制,以及基于生物网络的疾病和证候标志物的识别。这些研究呈现出计算、实验和临床相结合的趋势,是未来中药网络药理学研究的一个很有前途的方向。我中心智能计算事业部特举办“生物大数据时代的网络药理学研究模式研讨班”。培训班由我中心的一线分析工程师授课,通过技术讲座结合实验操作,展示应用实例,现场解答技术疑问,帮助学员拓展研究思路,提升科研水平和竞争力。
授课对象:生物信息学学员,高校生物、药学相关专业教师、学生,医学科研人员,医院从业人员,生物专业相关从业人员
电脑要求:64位windows10操作系统,运行日常程序流畅。
主办单位:北京市计算中心有限公司
协办单位:
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
云计算关键技术与应用北京市重点实验室
工业和信息化人才培养工程培训基地
北京市大数据教学实践基地
举 办 地:北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
课程安排:2025年7月9-11日(周三--周五) 上9:30-11:30 下13:30-17:00
日程安排:
第一天
主题1:网络药理学研究思路
1.网络药理学的发展历程和研究现状简介
2.网络药理学SCI论文研读分析
3.网络药理学的研究思路及技术路线
4.生物网络的介绍
5.网络分析介绍
主题2:中药有效成分查找和获取
6.中药有效成分及靶点查找和获取
1)常用中药数据及使用:TCMSP
2)中药高通量实验和参考数据库:Herb
3)中医药证候关联数据库:SymMap
4)CTD数据库
5)基于文献的草药成分和靶标数据库:HIT 2.0
6)中医药百科全书数据库:ETCM
7)中药分子机制研究的在线生物信息学分析工具:BATMAN-TCM
7.中药有效成分靶点预测的查询及获取
1)化合物与蛋白质互作:STITCH
2)中药有效成分靶点的预测:SwissTargetPrediction
3)基于有效成分结构特征靶点预测:PharmMapper
4)中药有效成分靶点的获取:反向虚拟筛选方法
5)SuperPred
6)SEA数据库
7)bSDTNBI数据库
第二天
主题3:疾病相关基因的获取
8.中药所治疗疾病的相关基因查找和获取
1)人类疾病与基因遗传变异数据库:OMIM
2)疾病相关的基因与突变位点数据库:DisGeNet
3)人类基因数据库:Genecards
4)治疗靶标数据库:TTD
5)CTD数据库
主题4:R语言和差异基因及功能富集分析
9.R语言介绍
10.GO富集分析
11.KEGG富集分析
主题5:网络药理学数据整理及分析
12.韦恩图的绘制
13.蛋白质互作网络查询和可视化分析:STRING
14.富集分析数据库:DAVID
15.Metascape功能富集分析和信号通路富集分析
16.富集GO term BP,CC,MF三合一柱状图绘制
17.通路气泡图的绘制
18.相互作用可视化PyMOL
第三天
主题6:网络药理学数据可视化
19.网络分析软件:Cytoscape
1)分析数据导入与导出
2)基本拓扑特征计算
3)重要节点识别
4)网络拓扑指标含义
5)子网络提取
6)网络可视化
7)图形导出
8)Cytoscape插件的安装和使用
20.蛋白结构数据库及结构数据的筛选和获取:PDB、Uniprot
21.小分子化合物结构信息查询:Pubchem、Drugbank
22.分子对接
1)对接软件的介绍及安装
2)小分子和蛋白结构文件的预处理
3)蛋白活性位点的确定
4)分子对接流程的介绍及实战
5)分子对接结果相互作用分析及可视化
注:内容以实际发生为准;若调,会提前通知。
【报名费用】
注册费:4200元/人(含当期听课费、资料费、证书费、考试费(如有))。
提供当期视频回放以供复习使用(羽林学院平台)。
开具增值税发票,提供盖章通知、结业证书等相关材料。
【报名优惠政策】
1、3人以上团体报名每人可减少300元;
2、4+1团报,可免费赠送一个名额;
3、上面优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种;
老学员参加及推荐学员参加均可额外优惠200元。
【报名回执】
【咨询请联系】
QQ号:2814500767
邮箱:bcc-sxpx@bcc.ac.cn
徐老师 010-59341786,15801436028(微信同号)
员老师 010-59341773,18701529461(微信同号)
【注】开课前一周会发送邮件通知;若未接到邮件通知,请电话咨询。